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来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （2） -- pigeon
下面我们通过使用isoseq collapse和 pigeon对转录本（isoforms）进行在参考基因组指导下的进一步合并（collapse），注释，分类和定量。一、Iso-Seq Collapse 在isoseq cluster完成以后，我们首先需要将高质量全长isoforms回贴到参考基因组上，然后进行isoseq collapse。 # 单个样本数据示例 $ isoseq collapse --do-not-collapse-extra-5exons <mapped.bam> <flnc.bam> <collapsed.gff> #使用说明 $ isoseq collapse --do-not-collapse-extra-5exons human_80K.mapped.bam human_80K.flnc.bam human into unique isoforms $ isoseq collapse --do-not-collapse-extra-5exons UHRR.mapped.bam UHRR.flnc.bam
3.2K11编辑于 2024-01-26
来自专栏sktj
bootstrap collapse
class="panel panel-default">

<div class="panel-body
73010发布于 2019-07-07
Bootstrap 折叠（Collapse）插件
用法下表列出了折叠（Collapse）插件用于处理繁重的伸缩的 class： Class 描述实例 .collapse 隐藏内容。尝试一下 .collapse.in 显示内容。通过 JavaScript：可通过 JavaScript 激活 collapse 方法，如下所示： $('.collapse').collapse() 选项有一些选项是通过 data 属性或 JavaScript $('#identifier').collapse({ toggle: false }) Toggle: .collapse('toggle') 切换显示/隐藏可折叠元素。 $('#identifier').collapse('toggle') Show: .collapse('show') 显示可折叠元素。 $('#identifier').collapse('show') Hide: .collapse('hide') 隐藏可折叠元素。
19910编辑于 2025-12-17
来自专栏cnblogs
Bootstrap源码分析之nav、collapse
rounded corners here since there is a hard edge above the menu @include border-top-radius(0); } 折叠效果(collapse )：源码文件： Mixins/_component-animations.scss：collapse实现，实现折叠效果 Javascripts/bootstrap/collapse.js：折叠效果实现 1、$this.data()收集所有data-*数据 2、Parent属性：指定当前这个collapse被那个父级所控制，主要实现一控多的效果，以下是隐藏同一父级下所有子列表代码： return $(this.options.parent) .find('[data-toggle="collapse"][data-parent="' + this.options.parent + ' ） $(“p”).find(‘.bak’).find(‘span’).end()：还原到$(“p”) 5、scrollHeight：页面的高度（获取为要展开的实际高度/宽度），包含视窗不可见的部分，在collapse
2K80发布于 2018-01-17
来自专栏韩曙亮的移动开发专栏
【CSS】盒子边框 ③ ( 设置表格细线边框 | 合并相邻边框 border-collapse: collapse； )
blue; } 设置完上述样式后 , 表格显示如下 : 上述单元格与单元格之间的边框 , 单元格与表格之间的边框 , 出现了重叠 , 每个重叠处都有两条线 ; 设置 border-collapse : collapse; CSS 样式 , 可以将相邻的边框合并在一起 , 合并边框后的效果 : 3、完整代码示例完整代码示例 : <! target="_blank"/> <style> table, th, td { border: 1px solid blue; /* 相邻边框合并在一起 */ border-collapse : collapse; } </style> </head> <body> <!
4.6K20编辑于 2023-03-30
来自专栏用户7873631的专栏
详解： 25 最难点： border-collapse: separate;
table代表这是一个表格 tr标签代表整个表格中的一行数据，只要一行都是属于他的，无论多长多一样 td代表单元格 border-collapse: separate;核心是为外边距合并起来，要设置在 } #container .table { border: 5px solid red; border-collapse
76810发布于 2020-10-28
来自专栏szhshp 的第四边境中转站
Bootstrap3.Collapse.Expandable Table
关于Collapse状态按钮图标注意以前写过一篇 collapse 的简单应用： Bootstrap.Collapse 这次还用到了 Expandable Table 和 Glyphicons 图标 Bootstrap 3 甚至是 mini ver 都包含了以下插件相关的 js 用例 (html 代码，防止被解析请清除 start tag 里面的空格) < tr data-toggle="<em>collapse</em> " aria-expanded="false"> …… </ tr> 几个要点：响应部分设置data-toggle="collapse" 设置 href 的值为对应被响应部分的选择器字串被响应部分设置class="collapse" aria-expanded="false" 使其能够被响应部分的 href 选择器选中即可关于 Collapse 状态按钮图标这里使用的是通过效果一段时间过渡，onclick 事件完成过快可能导致 collapse 效果和按钮变化不同步（多次点击可能出现显示错误，因为 collapse 太慢了 o(` · ~ · ′。)
1.1K30编辑于 2022-09-21
来自专栏三代测序-说
全基因组 - 人类基因组变异分析（PacBio) （3）-- pbmm2
Valid choices: (SUBREAD, CCS, ISOSEQ, UNROLLED). Alignment modes of --preset: SUBREAD : -k 19 -w 10 CCS or HiFi : -k 19 -w 10 -u ISOSEQ Valid choices: (SUBREAD, CCS, HIFI, ISOSEQ, UNROLLED). preset). [-1] --no-splice-flank Do not prefer splice flanks GT-AG (effective in ISOSEQ Sequence Manipulation Options: --collapse-homopolymers Collapse homopolymers in reads and
2.1K50编辑于 2023-11-23
来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （1）
Github主页：https://github.com/PacificBiosciences/IsoSeq软件安装：isoseq和lima#使用conda安装isoseq，v4.0.0. $ conda _primers_12.fasta human_80k.bam --isoseq --peek-guess对于iso-seq数据，使用--isoseq加--peek-guess参数来降低假阳性率。 $ isoseq refine human_80K.IsoSeqX_bc10_5p--IsoSeqX_3p.bam IsoSeq_v2_primers_12.fasta human_80K.flnc.bam （4）refine，使用isoseq refine去除poly(A)和嵌合体（concatemer）序列# Remove poly(A) tails and concatemer$ isoseq refine -verbose --use-qvs这里使用isoseq cluster，而不是isoseq cluster2, cluster相比于cluster2比较耗时。
16.7K21编辑于 2024-01-23
来自专栏喇叭的学堂
vue使用elementui的el-menu的折叠菜单collapse
由于我的是在el-menu所在组件外面的兄弟组件设置是否折叠的控制，我用事件总线bus进行是否折叠传递参数说明类型可选值默认值 collapse 是否水平折叠收起菜单（仅在 mode background-color="#001529" text-color="#fff" active-text-color="#1378e6" :unique-opened="true" :collapse template> <script> export default { name: "Menu", data() { return { // 在 el-menu 中绑定 :collapse }); }, }; </script> <style scoped> /* 设置展开宽度，不至于收缩出现bug */ .el-menu-vertical-demo:not(.el-menu--collapse
2K10编辑于 2024-03-11
来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （3）-- SQANTI3 v5.2
我们建议在使用SQANTI 3 前，先用cDNA_Cupcake(现在是isoseq collapse）或TAMA Collapse等工具来合并冗余的isoform，以供isoform的数量和质量。 isoseq collapse 所产生的 *.collapsed.gff是.gff2格式，和sqanti3_qc.py输入文件.gtf格式一样，所以是通用的。不需要用gffread进行转化。 out.gtf #GTF转换GFF3 $ gffread input.gtf -o out.gff3 4).cDNA_cupcake 已经停止更新了，被官方iso-seq所吸纳取代，因此iso-seq collapse 和TAMA collapse的输出.gff文件都被官方建议作为sqanti3_qc.py的输入文件。
3.9K11编辑于 2024-01-28
来自专栏设计模式
elasticsearch去重：collapse、cardinality、terms+top_hits实现总结
一、collapse折叠去重 elasticsearch中的collapse功能允许用户对搜索结果进行分组，这在某些情况下可以看作是一种去重操作。原理 collapse功能基于一个或多个字段的值对搜索结果进行分组。当你指定了collapse参数后，Elasticsearch会在后台对匹配的文档进行分组，并且每个分组只会返回一个代表文档。在使用collapse时，请务必考虑这些限制和注意事项，以确保查询的准确性和性能。通过合理规划和优化查询，可以充分利用collapse的分组功能，同时避免潜在的性能瓶颈。使用collapse功能原理：collapse功能通过指定一个字段来对搜索结果进行分组，并且每组只返回一个最佳匹配的文档（通常是基于排序字段的最高或最低值）。灵活性：相对较低。而collapse则更简单直接，只基于一个字段进行分组。性能：对于大数据集，collapse可能更高效，因为它避免了复杂的聚合计算。然而，实际性能还取决于具体的使用场景和数据分布。
6K10编辑于 2024-07-01
来自专栏从零开始学自动化测试
python测试开发django-188.Bootstrap折叠（Collapse）插件
前言折叠（Collapse）插件可以很容易地让页面区域折叠起来。如果您想要单独引用该插件的功能，那么您需要引用 collapse.js， bootstrap已经包含了这个插件。单击下面的按钮以通过类更改显示和隐藏另一个元素： .collapse隐藏内容 .collapsing在过渡期间应用 .collapse.in显示内容 <! collapse() .collapse(options) 将您的内容激活为可折叠元素。 shown.bs.collapse, hidden.bs.collapse `.collapse('show') 显示可折叠元素。在可折叠元素实际显示之前（即在事件发生之前）返回给调用者。 shown.bs.collapse .collapse(‘hide’) 隐藏可折叠元素。在可折叠元素实际被隐藏之前（即在事件发生之前）返回给调用者。
4K50编辑于 2022-03-10
来自专栏天意生信俱乐部
三代测序100问（8）| 三代全长转录本该如何鉴定？
PacBio平台：Lima与IsoSeq3的珠联璧合对于PacBio平台，其全长转录本的鉴定流程通常较为自动化且高效。精修（Refine）与嵌合体去除尽管lima已经去除了大部分非全长序列，但为了进一步确保序列的“纯度”，特别是去除潜在的转录本嵌合体（即两个不相关转录本错误连接在一起的序列），PacBio官方提供了IsoSeq3 “如果想进一步去除序列中可能残余的poly(A)尾，以及一些在建库过程中偶发产生的转录本嵌合体，可以使用IsoSeq3的refine命令，如图中第三步所示。”李老师补充道。
35100编辑于 2025-07-04
来自专栏Bug Engineer
Bootstrap Collapse（手风琴）插件添加加减号、三角形图标
折叠（Collapse）插件也叫手风琴插件，是一个页面中常用的组件通常我们会需要 “+” “-” “▷”等符号对其进行装饰，默认“+”，展开后变为“-”号，转换三角形的角度等实现的方法有很多种，下边介绍下我使用的方法下表列出了折叠（Collapse）插件中要用到的事件。 $(document).ready(function() { //点击折叠时运行该函数 $('.panel').on('hide.bs.collapse show.bs.collapse', function (e) { var $this = $(this) $this.find("span
62410编辑于 2023-12-25
来自专栏Coco的专栏
由position属性引申的关于css的进阶讨论（包含块、BFC、margin collapse）
：面试的时候问个css的position属性能刷掉一半的人这是啥情况…… 其实这问题我本来打算的是可以顺着一路扯到normal flow、containing block、bfc、margin collapse 但是更深一步去讨论，牵扯出诸如上文提到的normal flow、containing block、bfc、margin collapse，base line，writing mode，bidi，又有多少人能很好的回答完整呢即是在BFC中相邻的块级元素的垂直边距会折叠（collapse）。
1.5K50发布于 2018-05-28
来自专栏三代测序-说
全长转录组 | Oxford Nanopore (ONT) 三代全长转录组分析流程 -- 数据质控和预处理
三、ONT全长转录组的分析流程PacBio全长转录组有官方自己开发优化的转录本聚类软件软件和流程，IsoSeq（https://isoseq.how/）。一类是依赖参考基因组及其注释文件，如FLAIR，TAMA，TALON等；一类是reference-free，如IsoSeq, LyRic。
8.6K23编辑于 2024-02-05
PBMM2，新一代PacBio数据处理工具
支持预设参数，以适应不同类型的PacBio数据（如SUBREAD, CCS, ISOSEQ, UNROLLED）。
39810编辑于 2025-01-13
来自专栏sktj
jquery 手风琴效果

<div class="panel-body ').prev('.panel-heading').addClass('active'); $('#accordion, #bs-<em>collapse</em>') .on('show.bs.<em>collapse</em>
3.7K20发布于 2019-08-23
来自专栏sktj
bootstrap 折叠
collapse //collapse in $('.collapse').collapse() image.png image.png <div class 第 1 部分--hide 方法

<div 第 2 部分--show 方法

<div class 第 3 部分--toggle 方法

<div 第 4 部分--options 方法

<div
2.7K20发布于 2019-07-05

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全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （2） -- pigeon

bootstrap collapse

<div class="panel-body
73010发布于 2019-07-07

<div class="panel-body

Bootstrap 折叠（Collapse）插件

Bootstrap源码分析之nav、collapse

【CSS】盒子边框 ③ ( 设置表格细线边框 | 合并相邻边框 border-collapse: collapse； )

详解： 25 最难点： border-collapse: separate;

Bootstrap3.Collapse.Expandable Table

全基因组 - 人类基因组变异分析（PacBio) （3）-- pbmm2

全长转录组 | Iso-Seq 三代测序数据分析流程 (PacBio) （1）

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Bootstrap Collapse（手风琴）插件添加加减号、三角形图标

由position属性引申的关于css的进阶讨论（包含块、BFC、margin collapse）

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PBMM2，新一代PacBio数据处理工具

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